Ulama kondang ini, kemudian mendapatkan beasiswa pendidikan untuk belajar ke Hadramaut, Mekah, Madinah dan negara-negara lainnya.
Akhirnya, pada November 2020, Habib Luthfi bin Yahya mendapat gelar Doktor Honoris Causa (H.C) Bidang Komunikasi Dakwah dan Sejarah Kebangsaan dari Universitas Negeri Semarang.***